Ваутер Версхюрен широко известен в Европе и США как один из лучших исполнителей, отдающих предпочтение музыке эпохи Барокко, главный фаготист Амстердамского Барочного Оркестра. Ведет активную концертную деятельность в качестве солиста и сотрудничает со многими знаменитыми ансамблями и оркестрами, специализирующимися на исполнении старинной музыки, такими как La Petite Bande (Франция), Академия стариной музыки (Англия), Concerto Palatino (Италия), Oltremontano и многими другими, а также гастролирует в дуэте с Кэтрин Кок (фортепиано, клавесин).

Сотрудничает со многими звукозаписывающими компаниями, среди которых Sony, Alpha, Erat, Antoine Marchand. В 2009 году совместно с Challenge Records была сделана запись неизвестных сонат Николауса фон Круфта, получившая множество восторженных отзывов в прессе разных стран мира. Является участником проекта Амстердамского Барочного Оркестра, осуществившего в 2008 году запись всех существующих кантат И.С. Баха.

Преподает в Королевской консерватории в Гааге и Консерватории в Утрехте. Совместно с ансамблем старинной музыки Caecilia-Concert является организатором летних курсов в Утрехте по старинной музыке XVI–XVII вв. Ежегодно проводит множество мастер-классов в Европе, США и на Ближнем Востоке, является одним из организаторов фестиваля старинной музыки Amherst Early Music Festival. Обладатель специального гранта Charles Burney Fund за исследования сочинений старинных композиторов и открытие неизвестных композиций для фагота.